金魚の水を換えるときは、水の変化によって金魚を弱らせないように気を付けて行います。
水道水を直接入れたり、水温差が５度以上有ると金魚は調子を悪くする場合があります。金魚の水は、必ず１日以上くみ置き、カルキ（塩素）を抜いた水を水槽のそばに置いておき、温度差が少なくなった頃合いをみて水換えをします。
バケツなどの水換え用の容器は、良く洗い、洗剤などが残っていないものを使用します。また、水を換える前の日と、当日、換えた日の翌日は餌を与えないようにしましょう。
また、水槽の中の砂利や赤玉などは、ぬるぬるしていますが、大切なバクテリアがたくさんいますので洗わないようにしましょう。ゴミや糞などを軽く流す程度にします。
水換えの頻度は、設置したばかりの水槽の場合はろ過バクテリアが繁殖していませんので設置後２〜３週間は１／３の水換えを２〜３日に一回程度、その後は１〜２週間に１回程度で良いといわれていますが、飼育環境によって違いがありますので、水質の状況に応じて適宜水換えを行うことが大切です。